En una soleada mañana de sábado a mediados de agosto, Alex Naka, ingeniero de proteínas en una empresa de tecnología médica en Alameda, California, decidió organizar lo que él mismo describió como “un pequeño hackathon” en la cocina de su novia. Armado con su computadora portátil, una taza de café y aproximadamente 80 procesadores de inteligencia artificial (IA) basados en la nube, Naka se embarcó en la creación de numerosas proteínas diseñadas para bloquear un receptor celular mutado presente en algunos tumores. De todas sus creaciones, seleccionó las diez más prometedoras para ingresarlas en una competencia reciente de diseño de proteínas organizada por Adaptyv Bio, una empresa emergente de biotecnología ubicada en Lausana, Suiza.
Competencias de Biotecnología Impulsadas por la Inteligencia Artificial
La competencia de Adaptyv Bio es una de al menos cinco que han surgido en el último año, atrayendo a participantes de todo el mundo que utilizan avanzadas herramientas de IA como AlphaFold y modelos de lenguaje inspirados en chatbots para diseñar nuevas proteínas. Estos concursos tienen como objetivo descubrir proteínas que puedan servir como medicamentos más efectivos, enzimas industriales o reactivos de laboratorio, ampliando las fronteras de la biotecnología moderna.
Impacto de las Herramientas de IA en el Diseño de Proteínas
El uso de inteligencia artificial en el diseño de proteínas ha demostrado ser una revolución en el campo, especialmente considerando que tres de los investigadores detrás de estas herramientas fueron galardonados con el Premio Nobel de Química de este año. Este reconocimiento subraya el impacto significativo y la esperanza que existe en el diseño de proteínas asistido por IA para avanzar en tratamientos médicos y aplicaciones industriales.
Desempeño y Experiencias en la Competencia de Adaptyv Bio
Durante la competencia, las creaciones de Alex Naka ascendieron rápidamente en la tabla de posiciones, destacando el poder de las herramientas de IA en el diseño de proteínas. No obstante, cuando se anunciaron los resultados a finales de septiembre, Naka se sintió decepcionado al descubrir que ninguna de sus diez propuestas funcionó en las pruebas de laboratorio. De las 147 proteínas evaluadas, solo cinco lograron unirse al receptor objetivo, y más de cincuenta no pudieron ser producidas. A pesar de estos resultados, Naka consideró la experiencia valiosa, describiéndola como “divertida tipo 2” – dolorosa en el momento, pero gratificante en retrospectiva.
Conexiones y comunidad científica
A través de la competencia, Naka estableció conexiones con otros científicos, como Anthony Gitter, destacando cómo estos eventos pueden reducir las barreras de entrada y fomentar una mayor participación en el diseño de proteínas. Este aspecto comunitario es fundamental para el avance colaborativo en la biotecnología.
Ganadores y Avances en el Diseño de Proteínas
Los ganadores de la competencia de Adaptyv Bio fueron Martin Pacesa y Lennart Nickel, biólogos estructurales del Instituto Federal Suizo de Tecnología (EPFL) en Lausana. Publicaron un preprint detallando su enfoque y hicieron su código de acceso libre, facilitando así avances futuros en el campo del diseño de proteínas asistido por IA.
Continuidad y Futuro de las Competencias
Debido al éxito del primer concurso, Adaptyv Bio ya ha lanzado una segunda competencia, incorporando las lecciones aprendidas anteriormente para mejorar la experiencia de los participantes y los resultados obtenidos.
Democratización del Diseño de Proteínas
Julian Englert, director ejecutivo y cofundador de Adaptyv Bio, señaló que la competencia no solo atrajo a ingenieros de proteínas experimentados, sino también a personas sin experiencia profesional en biología. Esto resalta el impacto democratizador de estos concursos, permitiendo que individuos con diferentes antecedentes contribuyan innovadoramente al diseño de proteínas.
Visión a Futuro en la Biotecnología
Englert compara las contribuciones de estos participantes con los inicios de gigantes tecnológicos como Apple y Microsoft, imaginando un futuro donde diseñadores freelance de proteínas colaboren en proyectos de moléculas personalizadas, ampliando las posibilidades de innovación y desarrollo en el campo biotecnológico.
En resumen, la competencia organizada por Adaptyv Bio ejemplifica la creciente tendencia de utilizar la inteligencia artificial en el diseño de proteínas. Este enfoque no solo fomenta la innovación y la construcción de comunidades científicas, sino que también acelera el progreso en investigaciones médicas e industriales, marcando un hito significativo en el avance de la biotecnología moderna.
